[High frequency of ancestral allele of the TJP1 polymorphism rs2291166 in Mexican population, conformational effect and applications in surgery and medicine]. / Alta frecuencia del alelo ancestral del polimorfismo rs2291166 de TJP1 en población mexicana, efecto conformacional así como las aplicaciones en cirugía y medicina.

BACKGROUND: TJP1 gene encodes a ZO-1 protein that is required for the recruitment of occludins and claudins in tight junction, and is involved in cell polarisation. It has different variations, the frequency of which has been studied in different populations. In Mexico there are no studies of this gene. These are required because their polymorphisms can be used in studies associated with medicine and surgery. Therefore, the aim of this study was to estimate the frequency of alleles and genotypes of rs2291166 gene polymorphism TJP1 in Mexico Mestizos population, and to estimate the conformational effect of an amino acid change. MATERIAL AND METHODS: A total of 473 individuals were included. The rs2291166 polymorphism was identified PASA PCR-7% PAGE, and stained with silver nitrate. The conformational effect of amino acid change was performed in silico, and was carried out with servers ProtPraram Tool and Search Database with Fasta. RESULTS: The most frequent allele in the two populations is the ancestral allele (T). A genotype distribution similar to other populations was found. The polymorphism is in Hardy-Weinberg, p>0.05. Changing aspartate to alanine produced a conformational change. CONCLUSIONS: The study reveals a high frequency of the ancestral allele at rs2291166 polymorphism in the Mexican population.

Asociación del gen ELMO1 (snp rs1345365) con el desarrollo de diabetes mellitus tipo 2 en población mestiza Mexicana / Association of the ELMO1 gene (snp rs1345365) with development of type 2 diabetes mellitus in the Mexican mestizo population

El locus g.37190613 en 7p14.2-14.1 del gen ELMO1 presenta un polimorfismo el cual consiste en un cambio G>A(rs1345365). Esta variante, entre otras, de ELMO1, ha sido asociada con nefropatía diabética en diferentes poblaciones. En México son limitados los estudios de asociación de diabetes mellitus con genes candidatos. Por ello, el objetivo del presente trabajo fue determinar la asociación del SNP rs1345365 del gen ELMO1 con el desarrollo de diabetes mellitus tipo 2 (DM2). Para ello se analizaron 148 pacientes con DM2, 156 individuos sin diabetes pero con factores de riesgo cardiovascular y 269 personas sanas sin DM2. El polimorfismo se identificó por PASA (PCR AMPLIFICATION ALLELE SPECIFIC) y PAGE teñida con nitrato de plata. La asociación se estableció por diferentes modelos de epidemiología genética; el modelo dominante mostró una asociación positiva (p=0,0006) como factor protector y el para-dominante mostró al estado heterocigoto como factor de riesgo. En conclusión el estudio reveló la asociación del SNP rs1345365 del gen ELMO1 con DM2 en una población mestiza Mexicana.

The g.37190613 locus on 7p14.2-14.1 in the ELMO1 gene has a G>A polymorphism (SNP rs1345365) that has been associated with diabetic nephropathy in different populations. The genetic-association studies in type 2 diabetes mellitus (DM2) on the Mexican population are limited. The aim of this study was to estimate whether the polymorphism G>A of ELMO1 gene is associated with the development of DM2. We included 148 DM2 individuals, 156 individuals with cardiovascular risk factors without diabetes and 269 healthy proband without DM2. The polymorphism was identified by PCR amplification specific allele (PASA), PAGE and silver staining. The association was established by genetic epidemiological models; the dominant model showed a positive association (p=0.0006) as a protective factor, and the para-dominant model to heterozygous, as risk factor. In conclusion, this study revealed the association of the SNP rs1345365 of the ELMO1 gene in a Mexican population.

[Polymorphism g.37190613 G>A of the ELMO1 gene in the Mexican population: potential marker for clinical-surgical pathology]. / Polimorfismo g.37190613 G>A del gen ELMO1 en población Mexicana, marcador potencial para la patología clínico-quirúrgica.

BACKGROUND: ELMO1 is a gene located at locus 7p14.2-14.1 that codifies a regulatory protein involved in fibrogenesis, cell migration, phagocytosis and apoptosis. This gene presents a single nucleotide polymorphism, which appears to be linked with the development of diabetic nephropathy. OBJECTIVES: Currently, there are no studies in regard to the presence of such polymorphism in the Mexican population. Therefore, the aim of this work was to estimate the frequency rate of alleles and genotypes of polymorphism rs1345365 from ELMO1 in Mexican mestizos who inhabit the west and the southeast regions of Mexico in order to generate reliable data for further association studies. METHODS: There were 322 individuals who were screened for the identification of polymorphism rs1345365 using genomic DNA from leucocytes as a template for PCR-PASA reactions. Amplicons were separated in 7% PAGE and visualized after staining with silver nitrate. RESULTS: The reference allele (A) was the most frequent in both western and southeastern populations of Mexico. In addition, a different genotype distribution was found with respect to other populations. The results of this study indicate that both populations are in Hardy-Weinberg equilibrium. CONCLUSION: This study also reveals a low frequency rate of the ancestral genotype for the polymorphism rs1345365 in mestizos from the western and southeastern regions of Mexico.

ANTECEDENTES: el gen ELMO1 tiene su locus en 7p14.2-14.1 y codifica para una proteína que regula la fibrogénesis, migración celular, fagocitosis, y apoptosis. Tiene diferentes variaciones de cambio de una sola base asociadas con nefropatía diabética. En la población mexicana no hay estudios de variantes de este gen, y es necesario conocerlas porque pueden ser polimorfismos que posteriormente se usen en estudios de asociación. OBJETIVOS: estimar la frecuencia de alelos y genotipos del polimorfismo rs1345365 del gen ELMO1 en población mestiza del Occidente y de la región sureste de México. MATERIAL Y MÉTODOS: estudio descriptivo de alelos y genotipos del polimorfismo rs1345365 que se identificó con PCR-PASA y PAGE 7% teñida con nitrato de plata. RESULTADOS: se incluyeron 322 individuos y el alelo más frecuente en las dos poblaciones es el de referencia (A). Se encontró una distribución diferente a otras poblaciones respecto a los genotipos. En ambas poblaciones está en equilibrio de Hardy-Weinberg p< 0.05. CONCLUSIONES: el estudio revela una baja frecuencia del genotipo ancestral en población mexicana del polimorfismo rs1345365.

[Implications in primary health care of medical genetics and genomic in type 2 diabetes mellitus]. / Implicaciones en la atención primaria en salud de la genética y genómica en la diabetes mellitus tipo 2.

Type 2 diabetes mellitus is a complex disease and a global health problem. Therefore, the first level of health care should handle the approaches of medical genetics and genomics to reduce its incidence. The aim is to present perspectives analyzed by our group in two areas of genetics and its clinical application. Emphasis is placed on the coexistence of several genetic forms clinically detectable in patients with diabetes, missing heritability associated with low penetrance, and epigenomics mechanism. It is discussed the effect of genetic variation associated with resistance to insulin, beta-cell dysfunction, shaft incretin, and other points of interest, such as thrifty genotype hypothesis, conformational disease, genetically unknown foods, phenocopies as clinically silent hypercortisolism, molecular phytopharmacology in the clinical management. Finally, the result was displayed in the Mexican population from genetic studies and new findings of clinical importance, such as involvement of melatonin and effect of variations in the number of copies in a genomic region.

La diabetes mellitus tipo 2 es una enfermedad multifactorial y un problema de salud mundial. De ahí que en el primer nivel de atención en salud se deben manejar los abordajes de la genética médica y genómica para disminuir su incidencia. El propósito de este artículo es presentar perspectivas analizadas por nuestro grupo en dos áreas de la genética, así como su aplicación clínica. Se hace hincapié en la coexistencia de varias formas genéticas clínicamente detectables en el paciente diabético, la heredabilidad perdida relacionada con baja penetrancia y fenómenos epigenómicos. Se discute el efecto de la variación genética relacionada con la resistencia a la insulina, la disfunción de las células beta, el eje incretínico, otros puntos de interés como las hipótesis del genotipo ahorrador, la patología conformacional, comidas genéticamente desconocidas, fenocopias como el hipercortisolismo clínicamente silente y la fitofarmacología molecular en el manejo clínico. Finalmente, se muestran resultados de estudios genéticos en población mexicana y nuevos hallazgos de importancia en la clínica, como la participación de la melatonina y el efecto de las variaciones en el número de copias en una región genómica.

[Hypothyroidism incidence and thyrotropin serum levels in newborns]. / Incidencia de hipotiroidismo y niveles séricos de la tirotropina en neonatos.

BACKGROUND: congenital hypothyroidism is the third sub-clinic hereditary disease in Mexico. Infants with total or partial underactive thyroid gland presented at birth showed high levels of thyrotropin. This allows identifying patients at risk for developing it through screening tests. The aim was to determinate the incidence of neonatal congenital hypothyroidism in newborns in our hospital as well as set the cut-off value in screening test. METHODS: samples from 4049 cord blood of newborns were processed. TSH was measurement by ELISA. Probands with high values subsequently underwent to confirmatory testing TSH micro-particle immunoassay. RESULTS: the results showed incidence of hypothyroidism of 1.2 per 1000 newborns. The cut-off value obtained in the screening test was 26.63 mUI/L. CONCLUSIONS: TSH values showed a different distribution compared with previous studies in the Mexican population and also a higher hypothyroidism incidence.

Introducción: el hipotiroidismo congénito ocupa el tercer lugar de las enfermedades hereditarias subclínicas en México. Los neonatos con hipofunción total o parcial de la glándula tiroides presentan concentraciones altas de la tirotropina, lo que permite identificar los casos probables con riesgo para desarrollar hipotiroidismo mediante las pruebas de tamiz. El objetivo de esta investigación fue determinar la incidencia de hipotiroidismo congénito neonatal en los recién nacidos y establecer el valor de corte en el ensayo de la prueba de tamiz. Métodos: se procesaron 4049 muestras de sangre de cordón umbilical de recién nacidos. Se cuantificó la hormona estimulante de la tiroides mediante ELISA. A los niños con valores elevados se les realizó la prueba confirmatoria mediante ensayo inmunoenzimático de micropartículas. Resultados: se identificó una incidencia de hipotiroidismo de 1.2 por cada 1000 recién nacidos. El valor de corte para la hormona estimulante de la tiroides fue de 26.63 mUI/L en la prueba de tamiz. Conclusiones: los valores de la hormona estimulante de la tiroides mostraron una distribución diferente a los de otras investigaciones en población mexicana, así como una incidencia más elevada de hipotiroidismo.